ecSeq Bioinformatics GmbH, Leipzig

Einleitung / Überblick

Die ecSeq Bioinformatics GmbH ist ein Bioinformatik-Dienstleister mit Sitz in Leipzig. Das Unternehmen ist spezialisiert auf die Analyse von Hochdurchsatz-Sequenzierungsdaten (Next-Generation Sequencing, NGS) und unterstützt Kunden dabei, den maximalen Nutzen aus ihren Sequenzierungsexperimenten zu ziehen. Mit über einem Jahrzehnt Erfahrung im Bereich NGS und Bioinformatik bietet es fundierte Expertise und entwickelt individuelle Datenanalysestrategien

Tätigkeitsfelder

ecSeq Bioinformatics konzentriert sich auf drei wesentliche Geschäftsfelder. Zum einen bietet das Unternehmen vertragliche Forschungsdienstleistungen (Contract Research) in der Bioinformatik an. Ein weiterer Schwerpunkt liegt auf der wissenschaftlichen Due Diligence, beispielsweise für strategische Entscheidungen, die von Genomik-Technologien abhängen. Zudem organisiert es öffentliche Workshops und führt firmeninterne Schulungen zur NGS-Datenanalyse durch

Leistungen & Services

Das Leistungsspektrum umfasst die Entwicklung von Datenanalysestrategien, Expert Consulting und die Organisation von Trainings. Für die Due Diligence bietet das Unternehmen umfassende Bewertungen von Technologien, Methoden und Datenintegrität an. Im Bereich Contract Research übernimmt es die bioinformatische Auswertung von NGS-Daten. Die individuell gestaltbaren Kurse und Workshops reichen von praxisnahen Einführungen bis zu spezialisierten Fortbildungen

Schwerpunkte & Besonderheiten

Ein besonderer Fokus liegt auf höchsten wissenschaftlichen Standards, wobei alle Projekte strengen Validierungs- und Reproduzierbarkeitsanforderungen unterliegen. Das Unternehmen verfügt über ein umfangreiches Netzwerk aus führenden Wissenschaftlern in Genomik, Molekularbiologie und Statistik für fachspezifische Expertisen. Aus früheren Teilnehmerbewertungen von Workshops wird eine exzellente Strukturierung, ansprechend aufbereitetes Material und ein freundliches Lernumfeld hervorgehoben

Über uns / Über mich

Das Unternehmen ist ein Spin-off der Universität Leipzig und verfügt über einen starken Hintergrund in der Bioinformatik- und Genombiologie-Forschung, was sich in eigenen wissenschaftlichen Publikationen widerspiegelt. Das Team arbeitet gerne an wegweisender Forschung und beteiligt sich aktiv an kooperativen Wissenschaftsprojekten. Die ecSeq Bioinformatics GmbH verfolgt den Ansatz, dass ihre Tools Daten analysieren können, aber erst das Expertennetzwerk diesen Daten Bedeutung verleiht

Methoden, Arbeitsweise & Technologien

Die Arbeitsweise ist durch enge Zusammenarbeit mit dem Kunden geprägt. Für Trainings wird gemeinsam ein spezifischer Kursplan basierend auf den Bedürfnissen des Teams erstellt. Die Analysen erfolgen mit aktuellen wissenschaftlichen Methoden und die entwickelten Lösungen folgen Best Practices, sind benchmarked und getestet. Die Implementierung übernehmen professionelle Bioinformatiker, wobei die Lösungen als Standalone-Software oder Cloud-Computing-Lösungen ausgeführt werden können

• Technologie- und Methodenbewertung für NGS
• Validierung von Pipelines und Workflows
• Prüfung von Datenintegrität und Reproduzierbarkeit
• Einsatz von Tools für verschiedene NGS-Anwendungen (z.B. BWA, Bowtie2, TopHat, samtools, BEDtools)
• Automatisierung von NGS-Auswertungen

Zielgruppen & Anwendungsbereiche

Die Dienstleistungen richten sich sowohl an Unternehmen als auch akademische Institutionen, für die eine zuverlässige Datenanalyse innerhalb akzeptabler Zeiträume eine Herausforderung darstellen kann. Die vertragliche Forschungsarbeit konzentriert sich auf mehrere Schwerpunktbereiche. Die angebotenen Workshops richten sich an Einsteiger und Fortgeschrittene, die praktische Fähigkeiten in der NGS-Datenanalyse erlernen möchten

• Präklinische Forschung und Wirkstoffentdeckung
• Tier- und Pflanzenforschung in der Landwirtschaft
• Humangenetik und Präzisionsmedizin
• Krebsgenomik (Cancer Genomics)
• Evolutionsbiologie

Adresse & Kontaktdaten

• Für die Kontaktaufnahme und Anfahrt stehen folgende Informationen zur Verfügung
• Name: ecSeq Bioinformatics GmbH
• Straße: Sternwartenstr. 29
• PLZ Ort: D-04103 Leipzig
• Telefon: Nutzen Sie unseren Rückrufservice
• E-Mail: [email protected] (für Veranstaltungsanfragen)